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Amate Yuzuriha é uma colegial que vive pacificamente em uma colônia espacial flutuando no espaço. Quando ela conhece um refugiado de guerra chamado Nyaan, Amate é atraída para um esporte ilegal de duelo de mobile suit conhecido como Clan Battle. Sob o nome de entrada “Machu”, ela se envolve em batalhas ferozes dia após dia, pilotando o GQuuuuuuX. Nesse momento, um Mobile Suit Gundam não identificado, perseguido pela Força Espacial e pela polícia, aparece diante dela, acompanhado por seu piloto, um garoto chamado Shuji. Seu mundo está prestes a entrar em uma nova era.